Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPE65Q16518 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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