Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP6AP1Q15904 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP6AP1Q15904 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1Q15904 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms