Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85BQ15834 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85BQ15834 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms