Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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HERC1Q15751 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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HERC1Q15751 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
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HERC1Q15751 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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