Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT31Q15323 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT31Q15323 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms