Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF4Q15306 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF4Q15306 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF4Q15306 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF4Q15306 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF4Q15306 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF4Q15306 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF4Q15306 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF4Q15306 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF4Q15306 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF4Q15306 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF4Q15306 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF4Q15306 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF4Q15306 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF4Q15306 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF4Q15306 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF4Q15306 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF4Q15306 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF4Q15306 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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