Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAPTM4AQ15012 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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