Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC38.79■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
GAPVD1Q14C86 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC38.74■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
GAPVD1Q14C86 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
GAPVD1Q14C86 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
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