Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR1I3Q14994 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR1I3Q14994 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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