Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBX1Q14549 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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GBX1Q14549 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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GBX1Q14549 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GBX1Q14549 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBX1Q14549 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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