Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCARB2Q14108 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms