Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2H3Q13889 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2H3Q13889 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
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