Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKP1Q13835 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PKP1Q13835 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKP1Q13835 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
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