Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOFQ13790 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOFQ13790 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOFQ13790 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APOFQ13790 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOFQ13790 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOFQ13790 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOFQ13790 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOFQ13790 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOFQ13790 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOFQ13790 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOFQ13790 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOFQ13790 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOFQ13790 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOFQ13790 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOFQ13790 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APOFQ13790 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APOFQ13790 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOFQ13790 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOFQ13790 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOFQ13790 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOFQ13790 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOFQ13790 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOFQ13790 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOFQ13790 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOFQ13790 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOFQ13790 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOFQ13790 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOFQ13790 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOFQ13790 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOFQ13790 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOFQ13790 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOFQ13790 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOFQ13790 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOFQ13790 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOFQ13790 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOFQ13790 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOFQ13790 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOFQ13790 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APOFQ13790 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOFQ13790 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOFQ13790 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOFQ13790 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOFQ13790 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOFQ13790 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOFQ13790 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOFQ13790 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOFQ13790 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOFQ13790 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOFQ13790 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOFQ13790 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOFQ13790 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOFQ13790 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOFQ13790 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOFQ13790 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOFQ13790 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOFQ13790 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOFQ13790 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOFQ13790 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOFQ13790 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOFQ13790 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOFQ13790 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOFQ13790 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOFQ13790 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOFQ13790 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOFQ13790 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOFQ13790 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOFQ13790 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOFQ13790 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOFQ13790 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOFQ13790 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOFQ13790 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOFQ13790 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOFQ13790 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOFQ13790 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOFQ13790 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOFQ13790 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOFQ13790 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOFQ13790 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOFQ13790 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOFQ13790 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOFQ13790 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOFQ13790 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOFQ13790 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOFQ13790 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOFQ13790 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOFQ13790 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOFQ13790 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOFQ13790 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOFQ13790 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOFQ13790 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOFQ13790 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOFQ13790 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOFQ13790 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOFQ13790 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOFQ13790 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOFQ13790 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOFQ13790 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOFQ13790 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOFQ13790 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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