Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRR1Q13601 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRR1Q13601 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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