Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AP3B2Q13367 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AP3B2Q13367 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
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