Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
GRIN2BQ13224 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC38.68■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
GRIN2BQ13224 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC38.62■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
GRIN2BQ13224 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
GRIN2BQ13224 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC38.56■■■■□ 3.76
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