Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX3Q13185 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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