Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPA4Q13156 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPA4Q13156 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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