Protein–RNA interactions for Protein: Q13118

KLF10, Krueppel-like factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF10Q13118 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF10Q13118 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF10Q13118 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF10Q13118 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF10Q13118 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF10Q13118 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF10Q13118 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF10Q13118 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF10Q13118 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF10Q13118 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF10Q13118 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF10Q13118 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF10Q13118 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLF10Q13118 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLF10Q13118 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF10Q13118 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF10Q13118 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms