Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPS1Q13098 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPS1Q13098 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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