Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXC1Q12948 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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