Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt5.06□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 YJL068CYJL068C 900 nt5.06□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 SAM4YPL273W 978 nt5.06□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 PWP1YLR196W 1731 nt5.06□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 EEB1YPL095C 1371 nt5.05□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 DBF4YDR052C 2115 nt5.05□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 ABZ1YNR033W 2364 nt5.05□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 VID30YGL227W 2877 nt5.05□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 MHR1YDR296W 681 nt5.05□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.05□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 PDR16YNL231C 1056 nt5.05□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 NRM1YNR009W 750 nt5.05□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 DCC1YCL016C 1143 nt5.05□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 MNN2YBR015C 1794 nt5.05□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 COQ6YGR255C 1440 nt5.05□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 NOB1YOR056C 1380 nt5.04□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 NOP7YGR103W 1818 nt5.04□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 VTC2YFL004W 2487 nt5.04□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 CTS2YDR371W 1536 nt5.04□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 NSI1YDR026C 1713 nt5.04□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 YFL064CYFL064C 525 nt5.04□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 YJU2YKL095W 837 nt5.04□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 ELA1YNL230C 1140 nt5.04□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 RPA49YNL248C 1248 nt5.04□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 EXO1YOR033C 2109 nt5.04□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 YPR202WYPR202W 717 nt5.04□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 STE50YCL032W 1041 nt5.04□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 AVO1YOL078W 3531 nt5.03□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 CYK3YDL117W 2658 nt5.03□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 RPT4YOR259C 1314 nt5.03□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.03□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 TRP1YDR007W 675 nt5.03□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 UTR4YEL038W 684 nt5.03□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 CAM1YPL048W 1248 nt5.03□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 UBX2YML013W 1755 nt5.03□□□□□ -1.6
RRP42Q12277 THI21YPL258C 1656 nt5.02□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 YNL247WYNL247W 2304 nt5.02□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 MTW1YAL034W-A 870 nt5.02□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 YML131WYML131W 1098 nt5.02□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 YOR024WYOR024W 324 nt5.02□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 ELP2YGR200C 2367 nt5.02□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 VPS72YDR485C 2388 nt5.01□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 ATG20YDL113C 1923 nt5.01□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 MCX1YBR227C 1563 nt5.01□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 VMA13YPR036W 1437 nt5.01□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 PHM8YER037W 966 nt5.01□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 SUA5YGL169W 1281 nt5.01□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 PRP45YAL032C 1140 nt5.01□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 YKR073CYKR073C 321 nt5.01□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 SWP1YMR149W 861 nt5.01□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 DOM34YNL001W 1161 nt5.01□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 SLD7YOR060C 774 nt5.01□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 GAL10YBR019C 2100 nt5.01□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 AVT3YKL146W 2079 nt5.01□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 AIM17YHL021C 1398 nt5.01□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 MET7YOR241W 1647 nt5.01□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 YEL077CYEL077C 3834 nt5□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 ERD1YDR414C 1089 nt5□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 ETR1YBR026C 1143 nt5□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 PDC1YLR044C 1692 nt4.99□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 ADE13YLR359W 1449 nt4.99□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 NTH2YBR001C 2343 nt4.99□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 CNM67YNL225C 1746 nt4.99□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 VHS1YDR247W 1386 nt4.99□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 GLT1YDL171C 6438 nt4.99□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 PAP1YKR002W 1707 nt4.98□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 OCA5YHL029C 2040 nt4.98□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 SRG1SRG1 551 nt4.98□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 CBT1YKL208W 816 nt4.98□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 YNL019CYNL019C 855 nt4.98□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 YNL033WYNL033W 855 nt4.98□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 ERI1YPL096C-A 207 nt4.98□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 PZF1YPR186C 1290 nt4.98□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 YCL041CYCL041C 495 nt4.98□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 PMT2YAL023C 2280 nt4.98□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 YOR1YGR281W 4434 nt4.98□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 SIP5YMR140W 1470 nt4.97□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 CTR2YHR175W 570 nt4.97□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 RPL21BYPL079W 483 nt4.97□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 NDC1YML031W 1968 nt4.96□□□□□ -1.61
RRP42Q12277 APJ1YNL077W 1587 nt4.96□□□□□ -1.62
RRP42Q12277 RAT1YOR048C 3021 nt4.96□□□□□ -1.62
RRP42Q12277 NAG1YGR031C-A 492 nt4.96□□□□□ -1.62
RRP42Q12277 YJL107CYJL107C 1164 nt4.96□□□□□ -1.62
RRP42Q12277 ERG3YLR056W 1098 nt4.96□□□□□ -1.62
RRP42Q12277 BBP1YPL255W 1158 nt4.96□□□□□ -1.62
RRP42Q12277 SIA1YOR137C 1869 nt4.96□□□□□ -1.62
RRP42Q12277 HXT5YHR096C 1779 nt4.96□□□□□ -1.62
RRP42Q12277 XPT1YJR133W 630 nt4.95□□□□□ -1.62
RRP42Q12277 MDY2YOL111C 639 nt4.95□□□□□ -1.62
RRP42Q12277 ISU2YOR226C 471 nt4.95□□□□□ -1.62
RRP42Q12277 ECM33YBR078W 1290 nt4.95□□□□□ -1.62
RRP42Q12277 ATE1YGL017W 1512 nt4.95□□□□□ -1.62
RRP42Q12277 GDB1YPR184W 4611 nt4.95□□□□□ -1.62
RRP42Q12277 BPL1YDL141W 2073 nt4.94□□□□□ -1.62
RRP42Q12277 RML2YEL050C 1182 nt4.94□□□□□ -1.62
RRP42Q12277 ECM7YLR443W 1347 nt4.94□□□□□ -1.62
RRP42Q12277 SYG1YIL047C 2709 nt4.94□□□□□ -1.62
RRP42Q12277 IMA1YGR287C 1770 nt4.93□□□□□ -1.62
RRP42Q12277 DAK1YML070W 1755 nt4.93□□□□□ -1.62
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