Protein–RNA interactions for Protein: Q12113

TY2B-OR1, Transposon Ty2-OR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-OR1Q12113 SPL2YHR136C 447 nt7.61□□□□□ -1.19
TY2B-OR1Q12113 LEM3YNL323W 1245 nt7.61□□□□□ -1.19
TY2B-OR1Q12113 RGS2YOR107W 930 nt7.61□□□□□ -1.19
TY2B-OR1Q12113 FAP1YNL023C 2898 nt7.6□□□□□ -1.19
TY2B-OR1Q12113 FUN19YAL034C 1242 nt7.6□□□□□ -1.19
TY2B-OR1Q12113 ELC1YPL046C 300 nt7.6□□□□□ -1.19
TY2B-OR1Q12113 ARF2YDL137W 546 nt7.59□□□□□ -1.19
TY2B-OR1Q12113 CIA2YHR122W 696 nt7.59□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 SUT1YGL162W 900 nt7.58□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 RFC2YJR068W 1062 nt7.58□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 MRI1YPR118W 1236 nt7.57□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 RPL7AYGL076C 735 nt7.56□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt7.56□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt7.56□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt7.56□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 NQM1YGR043C 1002 nt7.56□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 RPL7BYPL198W 735 nt7.56□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 CEF1YMR213W 1773 nt7.55□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 HIR2YOR038C 2628 nt7.55□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 SPR6YER115C 576 nt7.55□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 BRF1YGR246C 1791 nt7.55□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 SSH4YKL124W 1740 nt7.54□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 YFL042CYFL042C 2025 nt7.54□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 SNT2YGL131C 4212 nt7.54□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 NHP6BYBR089C-A 300 nt7.54□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 URE2YNL229C 1065 nt7.54□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt7.54□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt7.54□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 BUD16YEL029C 939 nt7.53□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 RFU1YLR073C 603 nt7.53□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 ISU2YOR226C 471 nt7.53□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 MNN4YKL201C 3537 nt7.53□□□□□ -1.2
TY2B-OR1Q12113 PDC1YLR044C 1692 nt7.52□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 YFL034WYFL034W 3222 nt7.52□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 HEM3YDL205C 984 nt7.52□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 CHO1YER026C 831 nt7.52□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 CTR2YHR175W 570 nt7.52□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 NPT1YOR209C 1290 nt7.52□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 YPL199CYPL199C 723 nt7.52□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 HPF1YOL155C 2904 nt7.51□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 RPT2YDL007W 1314 nt7.51□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 GMC1YDR506C 1827 nt7.51□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 ATG26YLR189C 3597 nt7.51□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 RCK1YGL158W 1539 nt7.51□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 UBC8YEL012W 657 nt7.51□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 MTW1YAL034W-A 870 nt7.51□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 AIF1YNR074C 1137 nt7.51□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 CTS1YLR286C 1689 nt7.5□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 SAP30YMR263W 606 nt7.5□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 UMP1YBR173C 447 nt7.5□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 DPB4YDR121W 591 nt7.48□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 BIM1YER016W 1035 nt7.48□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 YGR066CYGR066C 879 nt7.48□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 XPT1YJR133W 630 nt7.48□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 BUD9YGR041W 1644 nt7.48□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 CLN1YMR199W 1641 nt7.48□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 IWR1YDL115C 1062 nt7.48□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 MRPL15YLR312W-A 762 nt7.48□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 HOR7YMR251W-A 180 nt7.47□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 FRT2YAL028W 1587 nt7.47□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 MSB3YNL293W 1902 nt7.46□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 TIP41YPR040W 1071 nt7.46□□□□□ -1.21
TY2B-OR1Q12113 GRS1YBR121C 2004 nt7.46□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 PIC2YER053C 903 nt7.46□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 RPA49YNL248C 1248 nt7.46□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 CEG1YGL130W 1380 nt7.45□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 RTC1YOL138C 4026 nt7.45□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 YDL012CYDL012C 324 nt7.45□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 ABF1YKL112W 2196 nt7.45□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 YBL070CYBL070C 321 nt7.45□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 SLZ1YNL196C 897 nt7.45□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 NOP58YOR310C 1536 nt7.45□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 ICY2YPL250C 411 nt7.44□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 SAP4YGL229C 2457 nt7.44□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 YJR124CYJR124C 1347 nt7.44□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 SKG3YLR187W 3081 nt7.44□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 AIR2YDL175C 1035 nt7.43□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 YGL088WYGL088W 366 nt7.43□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt7.43□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 YGP1YNL160W 1065 nt7.43□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 KTR5YNL029C 1569 nt7.43□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 ACO1YLR304C 2337 nt7.43□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 ALD3YMR169C 1521 nt7.43□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 ALD2YMR170C 1521 nt7.43□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 AVT4YNL101W 2142 nt7.43□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 GPA1YHR005C 1419 nt7.42□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 SDA1YGR245C 2304 nt7.42□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 THI5YFL058W 1023 nt7.42□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 THI12YNL332W 1023 nt7.42□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 YPL278CYPL278C 303 nt7.42□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 GSP2YOR185C 663 nt7.41□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 ZUO1YGR285C 1302 nt7.4□□□□□ -1.22
TY2B-OR1Q12113 ETT1YOR051C 1239 nt7.4□□□□□ -1.23
TY2B-OR1Q12113 ADE3YGR204W 2841 nt7.4□□□□□ -1.23
TY2B-OR1Q12113 ESC8YOL017W 2145 nt7.4□□□□□ -1.23
TY2B-OR1Q12113 DAK1YML070W 1755 nt7.39□□□□□ -1.23
TY2B-OR1Q12113 NMD4YLR363C 657 nt7.38□□□□□ -1.23
TY2B-OR1Q12113 FUM1YPL262W 1467 nt7.38□□□□□ -1.23
TY2B-OR1Q12113 TRS23YDR246W 660 nt7.38□□□□□ -1.23
TY2B-OR1Q12113 BPL1YDL141W 2073 nt7.38□□□□□ -1.23
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