Protein–RNA interactions for Protein: Q12088

TY1B-LR1, Transposon Ty1-LR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-LR1Q12088 RGS2YOR107W 930 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-LR1Q12088 DCS2YOR173W 1062 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-LR1Q12088 MAG2YLR427W 2013 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1B-LR1Q12088 HXT4YHR092C 1731 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1B-LR1Q12088 RPL7AYGL076C 735 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 NQM1YGR043C 1002 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 RPL7BYPL198W 735 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 MRI1YPR118W 1236 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 NHP6BYBR089C-A 300 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 SNT2YGL131C 4212 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 BRF1YGR246C 1791 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 CIA2YHR122W 696 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 RFC2YJR068W 1062 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 ELC1YPL046C 300 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 HIR2YOR038C 2628 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 ARF2YDL137W 546 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 CEF1YMR213W 1773 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 YFL042CYFL042C 2025 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 CHO1YER026C 831 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 SPR6YER115C 576 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 SUT1YGL162W 900 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 SSH4YKL124W 1740 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 ISU2YOR226C 471 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 HPF1YOL155C 2904 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 PDC1YLR044C 1692 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 MNN4YKL201C 3537 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 URE2YNL229C 1065 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 CTR2YHR175W 570 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 MTW1YAL034W-A 870 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 YPL199CYPL199C 723 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1B-LR1Q12088 CLN1YMR199W 1641 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 YFL034WYFL034W 3222 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 NPT1YOR209C 1290 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 ATG26YLR189C 3597 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 BIM1YER016W 1035 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 GMC1YDR506C 1827 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 CTS1YLR286C 1689 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 BUD9YGR041W 1644 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 BUD16YEL029C 939 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 RFU1YLR073C 603 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 MRPL15YLR312W-A 762 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 AIF1YNR074C 1137 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 RCK1YGL158W 1539 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 IWR1YDL115C 1062 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 XPT1YJR133W 630 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 HOR7YMR251W-A 180 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 RPT2YDL007W 1314 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 HEM3YDL205C 984 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 YGR066CYGR066C 879 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 SAP30YMR263W 606 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 NSG2YNL156C 900 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 UMP1YBR173C 447 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 UBC8YEL012W 657 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 RTC1YOL138C 4026 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 RPA49YNL248C 1248 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 DPB4YDR121W 591 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 MSB3YNL293W 1902 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 SKG3YLR187W 3081 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 GRS1YBR121C 2004 nt7.21□□□□□ -1.25
TY1B-LR1Q12088 FRT2YAL028W 1587 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 PIC2YER053C 903 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 KTR5YNL029C 1569 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 SLZ1YNL196C 897 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 TIP41YPR040W 1071 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 YJR124CYJR124C 1347 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 YDL012CYDL012C 324 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 AIR2YDL175C 1035 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 AVT4YNL101W 2142 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 YBL070CYBL070C 321 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 YGP1YNL160W 1065 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 ICY2YPL250C 411 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 SDA1YGR245C 2304 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 ACO1YLR304C 2337 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 ABF1YKL112W 2196 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 ZUO1YGR285C 1302 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 NOP58YOR310C 1536 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 CEG1YGL130W 1380 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 SAP4YGL229C 2457 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 ALD3YMR169C 1521 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 ALD2YMR170C 1521 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 ECM30YLR436C 3825 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 YPL278CYPL278C 303 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 THI5YFL058W 1023 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 YGL088WYGL088W 366 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 THI12YNL332W 1023 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 ESC8YOL017W 2145 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 ETT1YOR051C 1239 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 ADE3YGR204W 2841 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 DAK1YML070W 1755 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1B-LR1Q12088 GSP2YOR185C 663 nt7.15□□□□□ -1.27
TY1B-LR1Q12088 GPA1YHR005C 1419 nt7.15□□□□□ -1.27
TY1B-LR1Q12088 FUM1YPL262W 1467 nt7.15□□□□□ -1.27
TY1B-LR1Q12088 EDC3YEL015W 1656 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1B-LR1Q12088 TRS23YDR246W 660 nt7.14□□□□□ -1.27
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