Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 VMA16YHR026W 642 nt5.55□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 TAF11YML015C 1041 nt5.55□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 SAM4YPL273W 978 nt5.55□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 YPR098CYPR098C 486 nt5.55□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 ICE2YIL090W 1476 nt5.55□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 YGL036WYGL036W 2730 nt5.55□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 ADE13YLR359W 1449 nt5.55□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 HRP1YOL123W 1605 nt5.55□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 ABZ1YNR033W 2364 nt5.55□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 ASH1YKL185W 1767 nt5.55□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 GET3YDL100C 1065 nt5.54□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.54□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 YIL060WYIL060W 435 nt5.54□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 SUE1YPR151C 621 nt5.54□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 QRI1YDL103C 1434 nt5.54□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 HXT3YDR345C 1704 nt5.54□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 YJR015WYJR015W 1533 nt5.53□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 YJL068CYJL068C 900 nt5.53□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 YKL107WYKL107W 930 nt5.53□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 RER2YBR002C 861 nt5.53□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 YFL034WYFL034W 3222 nt5.53□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 MNN2YBR015C 1794 nt5.52□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 DPH2YKL191W 1605 nt5.52□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 RGT1YKL038W 3513 nt5.52□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 UBA1YKL210W 3075 nt5.52□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 PDH1YPR002W 1551 nt5.52□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 TUL1YKL034W 2277 nt5.52□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 VCX1YDL128W 1236 nt5.52□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 MHR1YDR296W 681 nt5.52□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 SUA5YGL169W 1281 nt5.52□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 PDE1YGL248W 1110 nt5.52□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 CTR2YHR175W 570 nt5.52□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 LDB18YLL049W 540 nt5.52□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 ERG3YLR056W 1098 nt5.52□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 SEC13YLR208W 894 nt5.52□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 PGA2YNL149C 390 nt5.52□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 MED4YOR174W 855 nt5.52□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 ENV9YOR246C 993 nt5.52□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 ERI1YPL096C-A 207 nt5.52□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 ULA1YPL003W 1389 nt5.52□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 MND2YIR025W 1107 nt5.51□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 PRM10YJL108C 1152 nt5.51□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 KRE9YJL174W 831 nt5.51□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 GON7YJL184W 372 nt5.51□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 POM33YLL023C 840 nt5.51□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 PDR16YNL231C 1056 nt5.51□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 ETR1YBR026C 1143 nt5.51□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 DFG5YMR238W 1377 nt5.51□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 YLH47YPR125W 1365 nt5.51□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 NUP1YOR098C 3231 nt5.51□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 URA7YBL039C 1740 nt5.51□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 HFI1YPL254W 1467 nt5.51□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 ECM3YOR092W 1842 nt5.51□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 CBF1YJR060W 1056 nt5.5□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 YLR283WYLR283W 945 nt5.5□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 RET1YOR207C 3450 nt5.49□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 SNT2YGL131C 4212 nt5.49□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 YPL062WYPL062W 405 nt5.49□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 BBP1YPL255W 1158 nt5.49□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 YEF1YEL041W 1488 nt5.49□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 VPS1YKR001C 2115 nt5.48□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 THI21YPL258C 1656 nt5.48□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 HEM3YDL205C 984 nt5.48□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 CDC43YGL155W 1131 nt5.48□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 RPS19BYNL302C 435 nt5.48□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 ARO7YPR060C 771 nt5.48□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 UPS3YDR185C 540 nt5.47□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 GAT4YIR013C 366 nt5.47□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 GPM3YOL056W 912 nt5.47□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 HEM15YOR176W 1182 nt5.47□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 NPT1YOR209C 1290 nt5.47□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 SCP1YOR367W 603 nt5.47□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 NDC1YML031W 1968 nt5.47□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 VMA13YPR036W 1437 nt5.47□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 UBX2YML013W 1755 nt5.47□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 CLP1YOR250C 1338 nt5.47□□□□□ -1.53
VPS54Q12071 RTT103YDR289C 1230 nt5.46□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 PRP45YAL032C 1140 nt5.46□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 HOR7YMR251W-A 180 nt5.46□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 SSO1YPL232W 873 nt5.46□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 QDR1YIL120W 1692 nt5.46□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 RFA1YAR007C 1866 nt5.45□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.45□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 CLB4YLR210W 1383 nt5.45□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 GLO2YDR272W 825 nt5.45□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 OCA1YNL099C 717 nt5.45□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 COQ6YGR255C 1440 nt5.45□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 SMF3YLR034C 1422 nt5.45□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 RAT1YOR048C 3021 nt5.44□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 ASF2YDL197C 1578 nt5.44□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 RFA2YNL312W 822 nt5.44□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 RPN5YDL147W 1338 nt5.44□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 YAP1YML007W 1953 nt5.44□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 SRV2YNL138W 1581 nt5.43□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 ACC1YNR016C 6702 nt5.43□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 HXT5YHR096C 1779 nt5.43□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.43□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.43□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 YDR134CYDR134C 411 nt5.43□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 URA3YEL021W 804 nt5.43□□□□□ -1.54
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