Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNB2Q08289 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB2Q08289 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CACNB2Q08289 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNB2Q08289 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms