Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD51Q06609 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD51Q06609 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD51Q06609 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms