Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG1Q06432 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms