Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 UTR4YEL038W 684 nt4.81□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 PRS2YER099C 957 nt4.81□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 AUA1YFL010W-A 285 nt4.81□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 RCK1YGL158W 1539 nt4.81□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 RSC6YCR052W 1452 nt4.81□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 KCH1YJR054W 1494 nt4.81□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 NOT3YIL038C 2511 nt4.8□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 YDL034WYDL034W 345 nt4.8□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 PEX19YDL065C 1029 nt4.8□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 YDL144CYDL144C 1071 nt4.8□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 URA3YEL021W 804 nt4.8□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 PDE1YGL248W 1110 nt4.8□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 DNF2YDR093W 4839 nt4.8□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 CDC19YAL038W 1503 nt4.79□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.79□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 RPL21BYPL079W 483 nt4.79□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 QCR2YPR191W 1107 nt4.79□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 BRE2YLR015W 1518 nt4.78□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 ATG7YHR171W 1893 nt4.78□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 RPR2YIR015W 435 nt4.78□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 YKL107WYKL107W 930 nt4.78□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 ETT1YOR051C 1239 nt4.78□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 PRR1YKL116C 1557 nt4.78□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 EEB1YPL095C 1371 nt4.78□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 YPT32YGL210W 669 nt4.77□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 CAX4YGR036C 720 nt4.77□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 SPL2YHR136C 447 nt4.77□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 SPO7YAL009W 780 nt4.77□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 TIF2YJL138C 1188 nt4.77□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 TIF1YKR059W 1188 nt4.77□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 YLR126CYLR126C 756 nt4.77□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 ECM19YLR390W 339 nt4.77□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 SNO4YMR322C 714 nt4.77□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 HSP33YOR391C 714 nt4.77□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 snR17bsnR17b 332 nt4.77□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 HSP32YPL280W 714 nt4.77□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 MRPL36YBR122C 534 nt4.77□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 DCC1YCL016C 1143 nt4.77□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 SPC97YHR172W 2472 nt4.77□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 LYS21YDL131W 1323 nt4.76□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 UBX7YBR273C 1311 nt4.76□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 TOS4YLR183C 1470 nt4.76□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 TPS3YMR261C 3165 nt4.76□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 RPT6YGL048C 1218 nt4.76□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 CDC28YBR160W 897 nt4.76□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 MSH1YHR120W 2880 nt4.76□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 ROT2YBR229C 2865 nt4.76□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 SEC9YGR009C 1956 nt4.76□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 TOS3YGL179C 1683 nt4.76□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 SLC1YDL052C 912 nt4.75□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 CAD1YDR423C 1230 nt4.75□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 TFS1YLR178C 660 nt4.75□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 MRI1YPR118W 1236 nt4.75□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 YHR182WYHR182W 2358 nt4.74□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.74□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 MET31YPL038W 534 nt4.74□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 ATH1YPR026W 3636 nt4.74□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 YJL206CYJL206C 2277 nt4.74□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 ECT1YGR007W 972 nt4.73□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 NAG1YGR031C-A 492 nt4.73□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 MRP21YBL090W 534 nt4.73□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 ETR1YBR026C 1143 nt4.73□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 CAF4YKR036C 1932 nt4.73□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 PRO2YOR323C 1371 nt4.73□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 ZUO1YGR285C 1302 nt4.72□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 AXL2YIL140W 2472 nt4.72□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 YER084WYER084W 387 nt4.72□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 SCW10YMR305C 1170 nt4.72□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 LST8YNL006W 912 nt4.72□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 EMP46YLR080W 1335 nt4.72□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 ASK10YGR097W 3441 nt4.71□□□□□ -1.65
NEJ1Q06148 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt4.71□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 COS9YKL219W 1224 nt4.71□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 YKR073CYKR073C 321 nt4.71□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 YAR061WYAR061W 204 nt4.71□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 YMR245WYMR245W 621 nt4.71□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt4.71□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 GAL10YBR019C 2100 nt4.71□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 TDA7YNL176C 1911 nt4.71□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 AVT3YKL146W 2079 nt4.71□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 FUI1YBL042C 1920 nt4.7□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 LHP1YDL051W 828 nt4.7□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 IWR1YDL115C 1062 nt4.7□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 TRS23YDR246W 660 nt4.7□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 KTI12YKL110C 942 nt4.7□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 YCL012CYCL012C 405 nt4.7□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 NOC4YPR144C 1659 nt4.7□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 CRT10YOL063C 2874 nt4.7□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 PXA1YPL147W 2613 nt4.69□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 PAN1YIR006C 4443 nt4.69□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 ADE4YMR300C 1533 nt4.69□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 MAK32YCR019W 1092 nt4.69□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 YDR417CYDR417C 372 nt4.69□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 CBC2YPL178W 627 nt4.69□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 ARR3YPR201W 1215 nt4.69□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 APL6YGR261C 2430 nt4.69□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 KRE6YPR159W 2163 nt4.68□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 THP1YOL072W 1368 nt4.68□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 CLF1YLR117C 2064 nt4.68□□□□□ -1.66
NEJ1Q06148 YEL067CYEL067C 588 nt4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.9 ms