Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN11Q06124 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN11Q06124 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN11Q06124 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN11Q06124 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms