Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPN12Q05209 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PTPN12Q05209 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms