Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NUCB1Q02818 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NUCB1Q02818 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUCB1Q02818 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms