Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL18AQ02543 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms