Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CNTN2Q02246 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNTN2Q02246 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTN2Q02246 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms