Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
XPCQ01831 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
XPCQ01831 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
XPCQ01831 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
XPCQ01831 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
XPCQ01831 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
XPCQ01831 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
XPCQ01831 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
XPCQ01831 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
XPCQ01831 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
XPCQ01831 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
XPCQ01831 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
XPCQ01831 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
XPCQ01831 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
XPCQ01831 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
XPCQ01831 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
XPCQ01831 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
XPCQ01831 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
XPCQ01831 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
XPCQ01831 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
XPCQ01831 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
XPCQ01831 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
XPCQ01831 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
XPCQ01831 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
XPCQ01831 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
XPCQ01831 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
XPCQ01831 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
XPCQ01831 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
XPCQ01831 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
XPCQ01831 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
XPCQ01831 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
XPCQ01831 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
XPCQ01831 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
XPCQ01831 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
XPCQ01831 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
XPCQ01831 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
XPCQ01831 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
XPCQ01831 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
XPCQ01831 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
XPCQ01831 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
XPCQ01831 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
XPCQ01831 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
XPCQ01831 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
XPCQ01831 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
XPCQ01831 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
XPCQ01831 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
XPCQ01831 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
XPCQ01831 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
XPCQ01831 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
XPCQ01831 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
XPCQ01831 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
XPCQ01831 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
XPCQ01831 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
XPCQ01831 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
XPCQ01831 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
XPCQ01831 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
XPCQ01831 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
XPCQ01831 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
XPCQ01831 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
XPCQ01831 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
XPCQ01831 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
XPCQ01831 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
XPCQ01831 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
XPCQ01831 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
XPCQ01831 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
XPCQ01831 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
XPCQ01831 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
XPCQ01831 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
XPCQ01831 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
XPCQ01831 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
XPCQ01831 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
XPCQ01831 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
XPCQ01831 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
XPCQ01831 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
XPCQ01831 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
XPCQ01831 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
XPCQ01831 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
XPCQ01831 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
XPCQ01831 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
XPCQ01831 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
XPCQ01831 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
XPCQ01831 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
XPCQ01831 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
XPCQ01831 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
XPCQ01831 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
XPCQ01831 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
XPCQ01831 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
XPCQ01831 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
XPCQ01831 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
XPCQ01831 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
XPCQ01831 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
XPCQ01831 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
XPCQ01831 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
XPCQ01831 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
XPCQ01831 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
XPCQ01831 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
XPCQ01831 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
XPCQ01831 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
XPCQ01831 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
XPCQ01831 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.7 ms