Protein–RNA interactions for Protein: Q01581

HMGCS1, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS1Q01581 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMGCS1Q01581 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCS1Q01581 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms