Protein–RNA interactions for Protein: Q01453

PMP22, Peripheral myelin protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22Q01453 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PMP22Q01453 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMP22Q01453 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMP22Q01453 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms