Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL30P62888 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL30P62888 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL30P62888 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL30P62888 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL30P62888 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL30P62888 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL30P62888 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL30P62888 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL30P62888 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL30P62888 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL30P62888 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL30P62888 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL30P62888 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL30P62888 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL30P62888 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL30P62888 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL30P62888 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL30P62888 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL30P62888 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL30P62888 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL30P62888 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL30P62888 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL30P62888 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL30P62888 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL30P62888 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL30P62888 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL30P62888 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL30P62888 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL30P62888 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL30P62888 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL30P62888 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL30P62888 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL30P62888 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL30P62888 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL30P62888 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL30P62888 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL30P62888 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL30P62888 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL30P62888 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL30P62888 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL30P62888 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL30P62888 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL30P62888 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL30P62888 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL30P62888 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL30P62888 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL30P62888 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL30P62888 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL30P62888 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL30P62888 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL30P62888 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL30P62888 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL30P62888 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL30P62888 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL30P62888 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL30P62888 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL30P62888 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL30P62888 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL30P62888 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL30P62888 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL30P62888 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL30P62888 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL30P62888 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL30P62888 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL30P62888 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL30P62888 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL30P62888 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL30P62888 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL30P62888 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL30P62888 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL30P62888 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL30P62888 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL30P62888 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL30P62888 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL30P62888 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL30P62888 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL30P62888 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL30P62888 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL30P62888 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL30P62888 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL30P62888 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL30P62888 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL30P62888 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL30P62888 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL30P62888 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL30P62888 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL30P62888 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL30P62888 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL30P62888 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL30P62888 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL30P62888 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL30P62888 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL30P62888 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL30P62888 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL30P62888 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL30P62888 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL30P62888 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL30P62888 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL30P62888 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms