Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS28P62857 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS28P62857 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS28P62857 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS28P62857 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS28P62857 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS28P62857 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RPS28P62857 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPS28P62857 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPS28P62857 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPS28P62857 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPS28P62857 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS28P62857 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS28P62857 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS28P62857 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS28P62857 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS28P62857 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS28P62857 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS28P62857 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS28P62857 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS28P62857 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS28P62857 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS28P62857 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS28P62857 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS28P62857 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS28P62857 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS28P62857 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS28P62857 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS28P62857 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS28P62857 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS28P62857 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS28P62857 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS28P62857 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS28P62857 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS28P62857 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS28P62857 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS28P62857 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS28P62857 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS28P62857 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS28P62857 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS28P62857 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RPS28P62857 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RPS28P62857 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RPS28P62857 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RPS28P62857 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RPS28P62857 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RPS28P62857 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RPS28P62857 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RPS28P62857 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RPS28P62857 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RPS28P62857 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RPS28P62857 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RPS28P62857 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RPS28P62857 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RPS28P62857 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RPS28P62857 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RPS28P62857 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RPS28P62857 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RPS28P62857 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RPS28P62857 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RPS28P62857 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RPS28P62857 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RPS28P62857 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RPS28P62857 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RPS28P62857 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RPS28P62857 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RPS28P62857 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RPS28P62857 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RPS28P62857 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RPS28P62857 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RPS28P62857 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RPS28P62857 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPS28P62857 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPS28P62857 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPS28P62857 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPS28P62857 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPS28P62857 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPS28P62857 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPS28P62857 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPS28P62857 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPS28P62857 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPS28P62857 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPS28P62857 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPS28P62857 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RPS28P62857 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPS28P62857 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPS28P62857 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RPS28P62857 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPS28P62857 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPS28P62857 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPS28P62857 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPS28P62857 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPS28P62857 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPS28P62857 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPS28P62857 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPS28P62857 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPS28P62857 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPS28P62857 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS28P62857 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPS28P62857 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms