Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P61574 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms