Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS3AP61247 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS3AP61247 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS3AP61247 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms