Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNAP25P60880 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNAP25P60880 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms