Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB25P57735 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB25P57735 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB25P57735 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB25P57735 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB25P57735 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB25P57735 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB25P57735 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB25P57735 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB25P57735 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB25P57735 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB25P57735 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB25P57735 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB25P57735 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB25P57735 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB25P57735 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB25P57735 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB25P57735 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB25P57735 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB25P57735 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB25P57735 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB25P57735 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB25P57735 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB25P57735 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB25P57735 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB25P57735 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB25P57735 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB25P57735 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB25P57735 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB25P57735 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB25P57735 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB25P57735 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB25P57735 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB25P57735 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB25P57735 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB25P57735 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB25P57735 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB25P57735 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB25P57735 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB25P57735 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB25P57735 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB25P57735 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB25P57735 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB25P57735 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB25P57735 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB25P57735 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB25P57735 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB25P57735 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB25P57735 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB25P57735 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB25P57735 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB25P57735 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB25P57735 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB25P57735 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB25P57735 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB25P57735 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB25P57735 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB25P57735 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB25P57735 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB25P57735 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB25P57735 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB25P57735 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB25P57735 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB25P57735 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB25P57735 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB25P57735 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB25P57735 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB25P57735 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB25P57735 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB25P57735 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB25P57735 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB25P57735 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB25P57735 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB25P57735 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB25P57735 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB25P57735 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB25P57735 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB25P57735 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB25P57735 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB25P57735 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB25P57735 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB25P57735 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB25P57735 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB25P57735 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB25P57735 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB25P57735 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB25P57735 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB25P57735 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB25P57735 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB25P57735 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB25P57735 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB25P57735 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB25P57735 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB25P57735 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB25P57735 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB25P57735 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB25P57735 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB25P57735 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB25P57735 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB25P57735 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms