Protein–RNA interactions for Protein: P57087

JAM2, Junctional adhesion molecule B, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM2P57087 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
JAM2P57087 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
JAM2P57087 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
JAM2P57087 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
JAM2P57087 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
JAM2P57087 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
JAM2P57087 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
JAM2P57087 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
JAM2P57087 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
JAM2P57087 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
JAM2P57087 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
JAM2P57087 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
JAM2P57087 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
JAM2P57087 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
JAM2P57087 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
JAM2P57087 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
JAM2P57087 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
JAM2P57087 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
JAM2P57087 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
JAM2P57087 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
JAM2P57087 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
JAM2P57087 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
JAM2P57087 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
JAM2P57087 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
JAM2P57087 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
JAM2P57087 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
JAM2P57087 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
JAM2P57087 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
JAM2P57087 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
JAM2P57087 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
JAM2P57087 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
JAM2P57087 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
JAM2P57087 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
JAM2P57087 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
JAM2P57087 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
JAM2P57087 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
JAM2P57087 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
JAM2P57087 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
JAM2P57087 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
JAM2P57087 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
JAM2P57087 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
JAM2P57087 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
JAM2P57087 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
JAM2P57087 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
JAM2P57087 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
JAM2P57087 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
JAM2P57087 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
JAM2P57087 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
JAM2P57087 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
JAM2P57087 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
JAM2P57087 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
JAM2P57087 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
JAM2P57087 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
JAM2P57087 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
JAM2P57087 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
JAM2P57087 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
JAM2P57087 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
JAM2P57087 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
JAM2P57087 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
JAM2P57087 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
JAM2P57087 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
JAM2P57087 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
JAM2P57087 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
JAM2P57087 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
JAM2P57087 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
JAM2P57087 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
JAM2P57087 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
JAM2P57087 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
JAM2P57087 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
JAM2P57087 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
JAM2P57087 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
JAM2P57087 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
JAM2P57087 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
JAM2P57087 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
JAM2P57087 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
JAM2P57087 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
JAM2P57087 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
JAM2P57087 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
JAM2P57087 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
JAM2P57087 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
JAM2P57087 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
JAM2P57087 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
JAM2P57087 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
JAM2P57087 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
JAM2P57087 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
JAM2P57087 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
JAM2P57087 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
JAM2P57087 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
JAM2P57087 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
JAM2P57087 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
JAM2P57087 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
JAM2P57087 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
JAM2P57087 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
JAM2P57087 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
JAM2P57087 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
JAM2P57087 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
JAM2P57087 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
JAM2P57087 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
JAM2P57087 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
JAM2P57087 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms