Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BACE1P56817 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BACE1P56817 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BACE1P56817 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BACE1P56817 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BACE1P56817 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BACE1P56817 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BACE1P56817 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BACE1P56817 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BACE1P56817 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BACE1P56817 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BACE1P56817 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BACE1P56817 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BACE1P56817 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BACE1P56817 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BACE1P56817 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BACE1P56817 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BACE1P56817 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BACE1P56817 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BACE1P56817 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
BACE1P56817 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BACE1P56817 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BACE1P56817 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BACE1P56817 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
BACE1P56817 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BACE1P56817 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BACE1P56817 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BACE1P56817 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BACE1P56817 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BACE1P56817 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BACE1P56817 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BACE1P56817 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BACE1P56817 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BACE1P56817 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BACE1P56817 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BACE1P56817 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BACE1P56817 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BACE1P56817 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BACE1P56817 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BACE1P56817 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BACE1P56817 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BACE1P56817 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BACE1P56817 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BACE1P56817 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BACE1P56817 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BACE1P56817 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BACE1P56817 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BACE1P56817 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BACE1P56817 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BACE1P56817 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BACE1P56817 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BACE1P56817 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BACE1P56817 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BACE1P56817 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BACE1P56817 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BACE1P56817 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BACE1P56817 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BACE1P56817 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BACE1P56817 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BACE1P56817 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BACE1P56817 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BACE1P56817 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BACE1P56817 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BACE1P56817 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BACE1P56817 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BACE1P56817 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BACE1P56817 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
BACE1P56817 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BACE1P56817 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BACE1P56817 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BACE1P56817 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BACE1P56817 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BACE1P56817 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BACE1P56817 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BACE1P56817 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
BACE1P56817 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BACE1P56817 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BACE1P56817 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BACE1P56817 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BACE1P56817 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BACE1P56817 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BACE1P56817 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BACE1P56817 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BACE1P56817 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BACE1P56817 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BACE1P56817 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BACE1P56817 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BACE1P56817 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BACE1P56817 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BACE1P56817 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BACE1P56817 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BACE1P56817 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BACE1P56817 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BACE1P56817 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BACE1P56817 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BACE1P56817 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BACE1P56817 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BACE1P56817 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BACE1P56817 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BACE1P56817 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms