Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GFRA1P56159 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GFRA1P56159 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms