Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMTNP53814 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMTNP53814 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMTNP53814 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMTNP53814 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMTNP53814 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMTNP53814 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMTNP53814 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMTNP53814 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMTNP53814 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMTNP53814 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMTNP53814 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMTNP53814 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMTNP53814 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMTNP53814 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMTNP53814 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMTNP53814 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMTNP53814 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMTNP53814 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMTNP53814 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMTNP53814 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMTNP53814 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMTNP53814 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMTNP53814 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMTNP53814 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMTNP53814 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMTNP53814 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMTNP53814 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMTNP53814 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMTNP53814 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMTNP53814 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMTNP53814 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMTNP53814 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMTNP53814 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMTNP53814 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMTNP53814 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMTNP53814 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMTNP53814 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMTNP53814 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMTNP53814 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMTNP53814 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMTNP53814 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMTNP53814 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMTNP53814 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMTNP53814 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMTNP53814 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMTNP53814 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMTNP53814 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMTNP53814 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMTNP53814 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMTNP53814 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMTNP53814 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMTNP53814 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMTNP53814 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMTNP53814 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMTNP53814 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMTNP53814 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMTNP53814 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMTNP53814 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMTNP53814 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMTNP53814 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMTNP53814 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMTNP53814 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMTNP53814 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMTNP53814 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMTNP53814 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMTNP53814 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMTNP53814 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SMTNP53814 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMTNP53814 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMTNP53814 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMTNP53814 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMTNP53814 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMTNP53814 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SMTNP53814 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMTNP53814 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMTNP53814 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMTNP53814 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMTNP53814 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMTNP53814 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMTNP53814 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMTNP53814 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMTNP53814 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMTNP53814 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMTNP53814 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMTNP53814 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMTNP53814 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMTNP53814 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMTNP53814 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMTNP53814 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMTNP53814 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMTNP53814 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMTNP53814 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMTNP53814 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMTNP53814 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMTNP53814 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMTNP53814 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMTNP53814 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMTNP53814 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMTNP53814 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms