Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THOP1P52888 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THOP1P52888 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THOP1P52888 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THOP1P52888 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THOP1P52888 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THOP1P52888 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THOP1P52888 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THOP1P52888 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THOP1P52888 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THOP1P52888 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THOP1P52888 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THOP1P52888 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
THOP1P52888 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THOP1P52888 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THOP1P52888 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THOP1P52888 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THOP1P52888 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THOP1P52888 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THOP1P52888 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THOP1P52888 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THOP1P52888 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THOP1P52888 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THOP1P52888 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THOP1P52888 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THOP1P52888 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
THOP1P52888 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THOP1P52888 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THOP1P52888 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
THOP1P52888 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THOP1P52888 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THOP1P52888 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THOP1P52888 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THOP1P52888 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THOP1P52888 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THOP1P52888 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THOP1P52888 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THOP1P52888 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
THOP1P52888 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
THOP1P52888 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THOP1P52888 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THOP1P52888 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THOP1P52888 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THOP1P52888 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THOP1P52888 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THOP1P52888 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THOP1P52888 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THOP1P52888 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THOP1P52888 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THOP1P52888 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THOP1P52888 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THOP1P52888 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
THOP1P52888 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
THOP1P52888 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
THOP1P52888 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THOP1P52888 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
THOP1P52888 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
THOP1P52888 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THOP1P52888 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
THOP1P52888 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THOP1P52888 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THOP1P52888 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
THOP1P52888 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THOP1P52888 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THOP1P52888 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THOP1P52888 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
THOP1P52888 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THOP1P52888 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THOP1P52888 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THOP1P52888 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THOP1P52888 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THOP1P52888 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
THOP1P52888 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THOP1P52888 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THOP1P52888 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THOP1P52888 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THOP1P52888 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
THOP1P52888 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THOP1P52888 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THOP1P52888 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THOP1P52888 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
THOP1P52888 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THOP1P52888 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THOP1P52888 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THOP1P52888 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THOP1P52888 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THOP1P52888 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
THOP1P52888 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THOP1P52888 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THOP1P52888 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THOP1P52888 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THOP1P52888 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THOP1P52888 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THOP1P52888 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THOP1P52888 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THOP1P52888 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THOP1P52888 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THOP1P52888 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THOP1P52888 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THOP1P52888 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms