Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HK3P52790 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HK3P52790 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HK3P52790 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HK3P52790 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HK3P52790 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HK3P52790 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HK3P52790 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HK3P52790 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HK3P52790 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HK3P52790 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HK3P52790 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HK3P52790 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HK3P52790 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HK3P52790 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HK3P52790 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HK3P52790 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HK3P52790 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HK3P52790 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HK3P52790 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HK3P52790 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HK3P52790 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HK3P52790 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HK3P52790 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HK3P52790 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HK3P52790 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HK3P52790 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HK3P52790 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HK3P52790 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HK3P52790 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HK3P52790 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HK3P52790 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HK3P52790 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HK3P52790 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HK3P52790 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HK3P52790 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HK3P52790 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HK3P52790 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HK3P52790 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HK3P52790 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HK3P52790 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HK3P52790 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HK3P52790 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HK3P52790 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HK3P52790 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HK3P52790 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HK3P52790 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HK3P52790 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HK3P52790 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HK3P52790 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HK3P52790 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HK3P52790 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HK3P52790 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HK3P52790 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HK3P52790 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HK3P52790 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HK3P52790 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HK3P52790 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HK3P52790 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HK3P52790 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HK3P52790 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HK3P52790 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HK3P52790 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HK3P52790 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HK3P52790 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HK3P52790 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HK3P52790 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HK3P52790 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HK3P52790 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HK3P52790 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HK3P52790 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HK3P52790 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HK3P52790 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HK3P52790 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HK3P52790 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HK3P52790 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HK3P52790 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HK3P52790 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HK3P52790 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HK3P52790 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HK3P52790 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HK3P52790 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HK3P52790 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HK3P52790 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HK3P52790 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HK3P52790 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HK3P52790 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HK3P52790 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HK3P52790 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HK3P52790 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HK3P52790 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HK3P52790 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HK3P52790 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HK3P52790 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HK3P52790 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HK3P52790 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HK3P52790 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HK3P52790 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HK3P52790 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HK3P52790 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms